1958年由中国著名林学家郑万均教授提议建立莘口天然林保护区,1960年设立了莘口天然林保护区管理站,1964年8月原福建省林业厅具体确定了保护区的地点、面积与四周境界,1980年经福建省人民政府批准建立。保护区位于三元区和永安市境内,总面积800公顷。主要保护对象是以格氏栲林和米槠林为主的中亚热带常绿阔叶林生态系统和珍稀濒危野生植物。
区内分布有维管束植物183科1003种,国家重点保护野生植物有桫椤、金毛狗、南方红豆杉等6种,其中一级保护1种、二级保护5种;陆生脊椎动物83科390种,国家重点保护野生动物有中华鬣羚、鸳鸯、画眉、蟒蛇等12种,其中一级保护3种、二级保护9种。保存了世界上连片面积最大、密度最高的天然格氏栲森林。
资源管护:建有监控中心1个、重要卡口监控6个、路口监控36个,视频监控与省林业局系统联网。运用生态护林员管理系统落实网格化巡护工作。在保护区外围修筑了一条宽13米的防火隔离带,每年定期进行清理,建区以来未发生森林火灾。
科研监测:与福建师范大学合作建立福建三明森林生态系统国家野外科学观测研究站;与福建农林大学合作“中亚热带珍稀植物群落林窗更新过程及恢复技术研究”项目;开展格氏栲育苗技术研究,制定地方标准《格氏栲培育技术规程(DB35/T2007-2021)》,有效的解决了格氏栲种子自然发芽率低的问题,发表论文3篇,授权实用性专利1件。在野外布设红外监测设备27台。
宣传教育:建有科普宣教馆1处、宣教步道6千米,年接待访客1万多人次。
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